种蛋的存放的操作过程一般包括五个步骤，分别为选择、保存、包装、运榆与消毒。
　　（1）科学的选择：种蛋的来源应该是生产性能高而繁 繁殖力强和健康无病的柴肉种鸡群。新鲜的种蛋是提高孵化率 和健雏率的关键。所以种蛋越新鲜越好，一般夏季存放不超过7天，其他季节不超过15天。
　　蛋壳的颜色是重要的品种特征之一，应符合柴肉鸡品种要求。茧壳颜色为浅褐色或绿色，若出现异常颜色均不能采用。
　　蛋的形状大小也要符合品种要求，一般以50克左右为宜。超出标准范围110％的蛋不宜作种蛋用。蛋重过小，雏鸡体重小，体质弱，成活率低：蛋贡过大，则蛋壳较薄易破损、孵化率低。种蛋大小均匀可使出壳时间集中，雏鸡均匀一致。蛋形为椭圆、大小头分明有为好，过长过园、腰鼓状、橄榄状（两头尖）、沙壳、钢壳、过大过小等酌形蛋都应剔除。
　　蛋壳质量要厚薄适中，蛋壳结构应紧密均匀。厚度一般为0.33—0.35毫米之间，过厚影响蛋内水分蒸发，又难于啄壳出雏；过薄水分蒸发过快不利于胚胎发育。
　　利用照蛋检查能直接检出外观不易看到的不合格种蛋。利用照蛋器借助灯光可直接检查出裂纹蛋、双黄蛋、沙皮蛋、气室过大（即陈蛋）蛋、散黄蛋、血斑蛋、肉斑蛋等不合格种蛋。
　　（2）种蛋的保存：种蛋保存的好坏直接影响受精蛋的质量和孵化率。一般要求保存温度12—18霓，湿度70％—80％，要保持室内空气新鲜。一般认为保存时间不超过1周时不用翻蛋，超过l周时每天应困蛋1次，可明显提高孵化率。保存时间不宜超过2周，超过2周的种蛋孵化率明显下降，早期死胚多、弱雏也多。
　　（3）种蛋的包装：种蛋包装时用专用的种蛋包装箱包装。箱内种蛋用纸蛋托放置，每个蛋托放置30枚种蛋，这样包装的种蛋破损率低，便于运铺。
　　（4）种蛋的运输：运输种蛋时要做到防震、防雨淋、防冻、防晒，减少破损。最好利用特制的种蛋箱运输，用纸格一个一个隔开或特制的蛋托，每盘装30枚，一层一层放入蛋箱内，打包搁紧，或用木箱、竹篓垫一层锯末、麦秸、稻草等垫料放一层种蛋，压实挤紧最后压盖搁牢均可。要轻装轻卸，种蛋上不能压重物，不能站人踩踏，防止破损。
　　（5）种蛋的消毒：种蛋在柴种鸡场一般要进行1-2次消毒，入孵升温前远应进行彻底消毒，这对防止疾病的传播大有好处。常用的消毒方法有熏蒸、喷雾和浸泡三大类。具体方法如下；
　　1）喷雾消毒采用对胚始发台元影响的消毒药，在种蛋码盘后采用喷雾器从种蛋的上方和下方分别喷雾，使蛋壳表而的消毒液保持湿润5分钟。
　　2）浸泡消毒多用高锰酸钾或新洁而灭溶液，前者易使蛋壳氧化褪色变暗，不易照蛋。多用新洁丽灭浸泡，即用5％的新洁而灭原液加50倍清洁温水（40—43度）配成0.1％的消疼液，把种蛋放进去或把码好盘的种蛋带盘一起故人浸泡5分钟，即可装入机器孵化。
　　3）熏蒸法多采用福尔马林（甲醛）熏蒸法。方法是把种蛋码盘故入孵化器内关闭进出气口及门升温达25—30度时，在机内底板上放一体积比福尔马林量大10 倍的搪瓷瓦盆或陶瓷盆，计算好孵化器的容积，校每立方米空间15克高锰酸钾称量放人盆内，再校每立方米空间30毫升的福尔马林加入盆内，立即关闭孵化机门，使气体充满整个机内，消毒30分钟后打开机门取出盆子，打开风机让有害气体排出。开始正式升温。