家禽肠道细菌病日趋复杂，不仅严重危害中国养禽业的发展，带来巨大的经济损失，而且通过食源性传播、药物残留等方式，威胁人类健康，影响人类的公共卫生安全。
    1 影响家禽生产性能的充分发挥，生产能力下降
    家禽肠道细菌病影响家禽的生产性能，给养殖业将带来巨大的经济损失。以沙门氏菌为例，在中国，鸡白痢、鸡伤寒呈现高水平的地方流行（平均阳性率11.7%，最高达54.5%），沙门氏菌具有水平和垂直传播能力，鸡白痢、鸡伤寒从祖代到商品代逐级放大，导致雏鸡出现高死亡率。此外沙门氏菌、大肠杆菌等细菌病会影响家禽的料肉比、增重，导致产能下降。
    2 导致禽只的死亡，造成养殖户经济损失
    致病性的大肠杆菌、沙门氏菌等家禽肠道细菌病病原可导致禽只死亡，给养殖户造成重大的经济损失。2011年对湖北某县的鸡常见细菌病调查发现，大肠杆菌发病率为17.8%，发病鸡中有21.1%死亡，沙门氏菌发病率为11.8%，其中18.3%的病鸡死亡，链球菌病发病率为18%，其中16.1%的病鸡死亡。
    3 大量用药导致细菌的耐药性增强
    抗菌药物在防治细菌性疾病，保障人类健康和养殖业持续发展中功不可没，但也带来了很多问题。首先是养殖成本增加，调查发现部分42d出栏养鸡场每只鸡用药达1.5元，更为严重的是细菌耐药性增强，给细菌的防控带来了更大的挑战，例如1988年喹诺酮类药物开始在国内应用时，大肠杆菌对其几乎全部敏感，耐药率仅为0～3%，但数年后猛增至41%～54%。
    4 不规范用药导致药物残留
    据调查，造成兽药残留的原因主要有以下几个原因：不规范和不合理地使用药物、饲料加工或者运输中的污染以及贮存不当。不规范用药导致的药物残留一方面使细菌的耐药性增加，破坏生态环境，一方面给人体带来了毒性作用，危害人类健康，而且随着各个国家对食品安全的重视，药物残留极易引发食品安全问题和国际贸易争端。
    5 导致食源性传染病、威胁食品安全
    目前已认知的1145种人类传染性疾病中，有62%来源于动物，而在人类新出现的疫病中，75%是动物源性的。中国疾病预防控制中心报告的2007年全国微生物引起食物中毒数据显示，由沙门氏菌引起的发病人数比例达13.8%，居于首位，而弯曲菌也是全球范围内主要的人兽共患性肠道病菌之一。禽作为沙门氏菌、大肠杆菌、空肠弯曲杆菌等食源性细菌的存储器，这类细菌污染食品将会严重影响到人类健康，给公共卫生安全产生巨大的威胁。