抗菌药物主要是指抗生素和合成抗菌药。抗菌药物能干扰病原微生物细胞壁的合成，损伤菌体的细胞膜，影响菌体的蛋白质合成及核酸合成。
    一、合理应用抗菌药物
    合理应用抗菌药物是在明确指征的情况下选用适宜的药物，采用适宜的剂量和疗程，达到杀灭致病微生物和控制感染的目的。应用抗菌药物的同时应采取相应措施，增强畜禽免疫力，防止发生各种不良反应。
    二、明确用药指征
    1.正确的诊断是合理应用抗菌药的前提
    当畜禽发生疾病时应进行病原学检验、分离和鉴定病原菌后，有条件的必须进行药敏实验，并保留细菌标本供进行血清杀菌活力（SBA）实验。在药敏试验结果未知晓前或临床诊断相对明确的，可先进行试验性治疗。
    2.选用药物应综合考虑
    选用药物应结合药物的抗菌活性、药动学（吸收、分布、代谢、排泄、半衰期、生物利用度等）、药效学、不良反应、药源、价值与效益等加以综合考虑。无条件进行药敏试验的应选用本场或本地区不常用的药物，这样可以为临床用药提供经验。
    3.合理的剂量和疗程
    抗微生物药物的药效有赖于药品在畜禽体内的有效血药浓度。
    用药前要根据药物在畜禽体内的半衰期确定用药剂量和疗程。给药剂量应恰到好处，剂量过小起不到治疗作用，易使细菌产生抗药性；剂量过大，不仅造成浪费，还可能引起严重的毒副反应。药物的最低抑菌浓度（MIC）可作为衡量最低有效浓度的粗略指标。对危重病例常采用首次剂量加倍的方法进行治疗。
    4.注意用药疗程
    病原体在畜禽体内的生长繁殖有一个过程，药物起效需要一定的时间，这段起效时间即为疗程。疗程过短，病原菌的生长繁殖只能被暂时抑制，一旦停药，受抑的病原体又会重新生长繁殖，其后果是疾病复发或转为慢性。药物连续使用时间必须在一个疗程以上。不可用药1~2次就停药或急于调换药物品种。长期使用单一抗菌药不但浪费，还可能导致耐药菌株产生及引起毒副反应。
    5.正确确定给药途径
    常用给药方法：拌料、饮水、注射及气雾给药等。
    给药途径应根据药物的特性、剂型、患畜畜种、病情及病畜禽的食欲和饮水状况而定。
    选好给药途径可起到事半功倍的效果。如治疗呼吸道感染应用新霉素、链霉素时应采用气雾给药，因为这两种药物内服吸收效果差。肠道感染，则必须采用内服给药。同一种药物给药途径不同，会产生大相径庭的效果。同类药物给药途径不同，其效果也不一样，以青霉素类药物中的青霉素G和阿莫西林为例，青霉素G是从青霉菌培养液中提取的，在水中不稳定，极易被β-内酰胺酶和胃酸水解破坏，所以不应该混饮、混饲；阿莫西林为半合成制品，具有耐酸的优点，其内服效果良好。
    采用饮水给药要考虑药物的溶解度和畜禽的饮水量，确保畜禽吃到足量的药物。拌料给药时，应按递增混合法将药物与饲料充分混匀，尤其是安全范围小、剂量较小的药物更应混匀，以免动物采食药量过小起不到防治作用或因进食药量过大而中毒。
    对严重感染病例多采用注射法给药，对零星散养的家畜，注射给药疗效更为可靠。肌注药物时要注意药物的黏稠度，黏度大的药物，抽取的液量应适当超过规定的剂量，且注射的速度要慢一些。