在一般情况下，根据组织滴虫病的特异性肉眼病变和临诊症状便可诊断。但在并发有球虫病、沙门氏菌病、曲霉菌病或上消化道毛滴虫病等时，必须用实验室方法检查出病原体方可确诊。病原检查的方法是采集盲肠内容物，用加温至40℃的生理盐水稀释后，作成悬滴标本镜检。如在显微镜旁放置一个白热的小灯泡加温，即可在显微镜下见到能活动的火鸡组织滴虫。

　　鸡组织滴虫病：肝肿大，紫褐色，表面散在大小不等的圆形、黄绿或黄白色坏死灶，坏死灶中央稍下馅，边缘稍隆起，旱硬币状，周围常有红晕（出血带）。