臭蛋不仅污染环境影响孵化率，而且危害雏鸡健康。 其危害机理主要是：臭蛋内容物含大量绿脓杆菌，臭蛋一旦爆裂,其内侵入正常种蛋内部繁殖，引起这些正常发育种蛋胚胎死亡、发臭，变成另一臭蛋污染源，再污染其它种蛋，形成恶性循环。另外，臭蛋内高含有浓度的硫化氢气体，散发在孵化室内，影响胚胎的呼吸代谢。如果室内硫化氢达到较高浓度， 将造成胚胎窒息死亡，从而影响出雏率。