通风换气可使空气保持新鲜，减少二氧化碳以利胚胎正常发育。夏天，孵化器内的温度容易上升，应当把进气孔和出气孔全部打开。其他季节，特别是冬天，机温不容易保持。上第一期蛋时，头一、两天胚胎还很小，可以从蛋内得到氧气，这时可以把进、出气孔关上，使机内温度上升并保持平稳。孵化的头十天，机器里鸡蛋的胚胎都还处在发育前期，需要氧气的量不算太多，可以实行定时换气。每天2次，每次3小时。十天以后胚胎长大了，或者是循环、孵化，机内有各期胚胎，这时就应经常打开进、出气孔实行经常换气。特别是在机内有胚胎破壳出雏的情况下，更要保持经常通风换气。否则，正在破壳的胚胎或已出壳的小鸡就会被闷死。