由于球虫病无处不在，给养殖业带来了巨大的经济损失，因此各国都在积极研究防治球虫病的办法。到目前为止，已经采取了一些减少球虫病危害的措施：
   
    1.有计划、高效率地开发和使用抗球虫药。
   
　　2.加强饲养管理，保持清洁的饲养环境，尽量降低球虫感染几率。
   
　　3.球虫疫苗的研制和使用。
   
　　4.通过转基因技术，培育出具有抗球虫能力的种群。
   
    药物预防：在饲料中添加马杜拉霉素等进行预防，以及在疾病高峰期14天以后进行预防用药。
   
　　疫苗预防：在肉种鸡上，目前国内外普遍采用活球虫卵囊制成的疫苗来预防鸡球虫病，取得理想的效果，最近几年，在商品肉鸡上也有使用。
   
　　治疗：使用抗球虫药是目前应用最频繁，也是预防和治疗球虫病最有效的方法，但是在使用过程中存在的缺点依然不少。其中最主要的一点就是抗药性的产生过快，因此抗球虫药牵涉到一个合理的使用问题。
   
　　其次是要控制住细菌感染。
   
　　再其次是补充维生素，特别是维生素K、维生素B的补充。