休药期。使用抗球虫添加剂，不论是化学合成药物，还是聚醚类抗生素，在鸡体内都有一定的残留量。这些残留的药物对人体的健康有一定的危害性。因此应有一定的休药期，以降低药物在鸡体内的残留。一般在肉鸡上市前的几天和蛋鸡的产蛋期都应停药，以保证肉蛋产品符合有关卫生标准，维护人们的健康。
            
    持续使用。由于球虫卵囊有较强的生命力，在潮湿的土壤中能生存1年以上，鸡的整个生长过程都可能感染。因此，使用抗球虫添加剂应持续使用，不能随意中断，否则可能暴发球虫病，造成损失。
            
    使用剂量。使用剂量过小，起不到应有的预防效果，反而易使球虫产生耐药性以至暴发球虫病，过量使用则可能产生不良作用，甚至中毒死亡。特别是聚醚类抗生素使用剂量的安全范围较窄，例如，马杜拉霉素的常用剂量是5~6毫克/千克，超过6毫克/千克就对鸡的生长有明显的抑制作用，饲料利用率下降，因此，掌握好使用剂量是应用抗球虫添加剂的一个关键。
            
    注意使用禁忌。盐霉素、莫能菌素、拉沙钠菌素、氨丙啉、常山酮、尼卡巴嗪等药物之间有配伍禁忌，这些药物不能两种或两种以上同时使用；盐霉素、莫能菌素也不能与泰乐菌素、泰妙菌素和竹桃霉素同时使用，否则能引起生长抑制，甚至中毒死亡；氨丙啉与维生素B1有明显的拮抗作用，也应引起注意，以免降低药物效果。
            
    混合均匀性。由于抗球虫药物的用量都较少，因此最好能经过两次以上的预混后再使用，以确保较好的混合均匀度，保证药物稳定地发挥作用效果，并避免因混合不均匀而造成的药物中毒。