肠毒综合症作为一种多病因病，一直未被多数人认可。也正是因为没有一个统一的诊断标准，所以被诊断为该病的病也比较多，比如过料拉稀.球虫肠炎.坏死性肠炎等。但我认为只有那种能引起雏鸡尖叫、瘫痪、共济失调大死亡率的肠毒才是真正的肠毒综合症。
　　也就是说：肠毒综合症可以包括坏死性肠炎或和球虫混感，却绝不是单纯的这两种疾病。
　　肠毒综合症的诊断：
　　该病多发生在雏鸡7日龄免疫后，常出现零星尖叫、瘫痪共济失调，继而死亡的鸡只。个别鸡粪便变稀、不成形，粪中含有未消化的饲料，随着时间的延长，整个鸡群的大部分鸡开始腹泻，有的鸡群发生水泻，粪便变得更稀薄，不成形、不成堆、比正常的鸡粪所占面积大，粪便中有较多未消化的玉米碴和豆柏碴，粪便的颜色变浅，略显浅黄色或浅的黄绿色。继而排出肉色带肠粘膜的粪便。10-14日龄后逐渐增多，高的日死亡常可达到1%-1.5%。
　　大群鸡多精神正常，有的会有轻微甩鼻，死亡多集中于夜间。该病的发病情况为7日龄免疫时使用进口疫苗的比使用国产苗得重些。
　　发病初期，十二指肠、空肠的卵黄蒂之前的部分肠粘膜增厚，颜色变浅，呈灰白色，似一层厚厚的麬皮，极易剥离。
　　肠壁也增厚，肠腔空虚，内容物较少，时而见到一些未消化的饲料。严重的在小肠中后段充满橘黄色的柿子样、鱼肠样或胡萝卜样物质。
　　发病的中后期，肠壁变薄，肠粘膜也脱落，肠内物呈蛋清样、粘脓样或柿子样。并见肝脏出血，盲肠扁桃体肿胀出血，法氏囊萎缩，肾肿等。
　　常见发病原因：
　　1、小肠球虫的感染是本病的主要原因之一。小肠球虫主要寄生于肠粘膜上皮细胞中，当其大量生长繁殖时，必然导致肠粘膜增厚，水肿，严重脱落及出血等病变，则几乎使饲料不能被完全消化吸收，同时对水分的吸收也明显减少，尽管鸡大量饮水，也会引起脱水现象，所以发病鸡群所排的粪便就很稀薄且不成形，内含有没有被消化的饲料。
　　2、细菌能引起肠炎，也是肉鸡肠毒综合症的病因之一：如沙门氏菌、产气夹膜梭菌等，通过刺激破坏肠道黏膜，同时引起炎症使肠蠕动速度加快，消化液排泄过多，饲料通过消化道的时间缩短，导致消化不良。
　　3、病原微生物等原因引起肠道菌群失调，产生大量乳酸，使肠道内PH值严重降低，肠道内环境发生改变，有益菌减少有害菌大量繁殖，又由于此时肠道处于厌氧环境，梭菌等厌氧菌会大量繁殖，有害菌与球虫相互协调而加强了致病性。这样就会造成有益菌减少，而有害菌大量生长繁殖，特别是大肠杆菌、沙门氏菌能加重致病性。菌群所分泌的毒素增多，刺激肠道粘膜使肠蠕动加快，消化液排出增多，饲料通过肠道的时间缩短，消化不良，未消化的饲料随同脱落的粘膜一起排出体外，形成特征性的西红柿样或鱼肠样粪便
　　4、电解质大量流失：由于球虫和有害菌大量生长繁殖导致消化不良和肠道吸收障碍，使电解质吸收减少，同时，由于大量的肠粘膜细胞迅速破裂崩解，使电解质大量流失，出现生理生化障碍，特别是钾离子的大量流失，会导致心脏的兴奋性过度增强，这也是肉鸡猝死症明显增多的主要原因之一。
　　5、自体中毒：在发病的过程中，大量的肠道上皮细胞破裂，在细菌的作用下，发生腐败分解，以及脱落的肠粘膜、死亡的虫体等在体内发酵分解产生大量有毒物质，同时，肠道内异常菌群分泌的毒素均会被机体吸收后发生自体中毒，出现兴奋不安、尖叫、瘫痪而衰竭死亡等症状。