1.成鸡与雏鸡分开喂养，以免带虫的成年鸡散播病原导致雏鸡爆发球虫病。
　　2.保持鸡舍干燥、通风和鸡场卫生，定期清除粪便，并堆放发酵以杀灭卵囊。保持饲料、饮水清洁，笼具、料槽、水槽定期消毒，一般每周一次，可用沸水、热蒸气或3%~5%的热碱水等处理。补充足够的维生素K和给予3~7倍推荐量的维生素A，可加速鸡患球虫病后的康复。
　　3.雏鸡在3~4周龄之内，选用链霉素、土霉素等药物预防白痢病，同时也预防了球虫病。
　　4.终身给予预防药物，常用莫能霉素、盐霉素、奈良菌素、尼卡巴嗪、马杜拉霉素、硝苯酰胺、氯苯胍、地克珠利等，主要用于肉鸡。
　　5.人工免疫，大量的研究试验及生产实践都已证明，鸡只重复感染球虫2~3次后，即可产生坚强的抗球虫免疫保护力，从而使鸡只免受球虫病的侵害。因此，通过疫苗免疫预防球虫病是安全可行的。国外已有多种商品化球虫疫苗上市供应，并且在许多养鸡业先进的国家获得广泛应用，目前我国商品化的疫苗也已研制成功，因此，疫苗预防将会逐渐发展为防治鸡球虫病的主要手段之一。鸡球虫疫苗的大量推广使用，将为养鸡业的发展带来显著的经济效益、社会效益和生态效益。